求土地和财富。
由于同处于伊比利亚半岛之上，为了避免利益冲突。两国于1494年缔结了一个很脑残的，瓜分世界的协议，《托尔德西雅斯条约》。誓言要在新领地上传播天主教，后又于1529年签定了《萨拉戈萨条约》，规定以东经134度为分界线，西边归西班牙，东边归葡萄牙。正是这一条约的签订，使得葡萄牙在发现日本列岛的过程中抢占了先机。
葡萄牙的传教士非常的活跃，他们在日本大肆活动，一度取得了很大的成绩。信徒最多时，超过了75万人，日本的长崎已成为“远东的罗马”。
但在1609年，切支丹武士冈本大八和切支丹大名有马晴信的渎职事件，再一次改变了天主教的命运。德川幕府先后在1612年、1614年发布两次禁教令，由京都开始实行从局部到全国的大禁教。
幕府下令驱除传教士、关闭教会、毁坏教堂、禁止举行各种天主教仪式和集会。并强令信徒改宗，如拒绝则严惩。在德川幕府的残酷镇压迫害之下，传教活动进入了悲惨的衰败期。为了禁教，德川幕府特意发明许多残酷刑罚，如**游街、面部烙印、竹锯锯头、切指、磔杀、落谷、火熏、倒吊于粪坑中、踏绘等。
在德川幕府的残酷镇压、迫害的禁教政策之下，1640年葡萄牙人被迫退出日本，天主教在日传教活动至此宣告结束。