管东三省将军事务徐世昌、副都统衔署理吉林巡抚朱家宝上奏朝廷，请求在桦皮甸子设县，同年十月二十六日（1908年1月29日）清廷批准立县，定名桦甸，划吉林府东南境，磐石县西境归桦甸县管辖，桦甸建县后，归吉林省管辖。清朝时期，随着封禁政策的变化，桦甸逐渐有了更多的人口迁入，农业、商业得到进一步发展，形成了一些较大的村落和集市，中原文化在桦甸得到更广泛的传播，与当地的少数民族文化相互交融。
中华民国时期，1913年1月8日（民国2年），废除府、厅、州，一律改称为县，全省设四道，辖37县，桦甸县仍属于西南路道，同时，桦甸县衙门改为桦甸县公署。1914年（民国3年）6月，西南路道改为吉长道，桦甸县属于吉长道。1925年4月（民国14年），桦甸县政统一，结束了“韩边外”统治江东的历史。1929年（民国18年）废除道制，各县直隶于省，桦甸县公署改为桦甸县政府。1931年（民国20年），“九·一八”事变后，东北沦陷，桦甸县仍属于吉林省。此后，日伪对东北行政区划多次调整，桦甸县在不同时期均属吉林省。1945年（民国34年）8月16日，由沦陷时期日伪县公署原人员组成“县地方维持委员会”，8月31日，中华民国政府决定东北并为9省，桦甸县仍属吉林省。11月28日东北民主联军解放桦甸，12月1日，成立桦甸县民主政府，隶属于吉林省。1946年5月29日，东北民主联军实行战略转移，国民党军队进据桦甸县城及松花江西各区，6月9日成立桦甸县政府，属吉林省管辖。7月11日，桦甸县民主政府转移到地窑子屯，归吉林省吉南专署管辖。1947年6月1日收复桦甸县城，桦甸县民主政府迁回，改称桦甸县人民政府，直属吉林省管辖。1949年4月12日，全国划为五大行政区，东北行政区管辖东北六省，桦甸县直辖于吉林省。在民国时期，桦甸经历了政权的更迭和战争的洗礼，社会经济发展受到一定影响，但也在艰难中缓慢前行，教育、文化等领域逐渐引入了新的理念和元素。
中华人民共和国成立后，1949年10月1日起，桦甸县为吉林省省直辖。1958年9月27日，吉林省决定成立六个行政区，桦甸县属吉林地区管辖。1969年5月1日，实行市管县新体制，桦甸县属吉林市管辖。1988年5月25日经国务院批准撤县设市，从此，桦甸市在改革开放的浪潮中，经济与社会发展迅速，逐渐成为吉林省东部山区的经济强县（市）之一。新中国成立后，桦甸迎来了新